All publications (2025-11-11)

2025

1. S. Kovalchuk, Y. Li, D. Fedrushkov Prediction of code generation perceiving by human developer as a decision process // Proceedings of the Fourth Workshop on Bridging Human-Computer Interaction and Natural Language Processing (HCI+NLP), 2025, pp. 120-128.
2. А.Ю. Кузьмин, О.О. Гофман, С.В. Ковальчук Цифровые технологии поддержки принятия решений в юриспруденции: психологический профиль и доверие пользователей // Управленческое консультирование, 2025, №5, с. 106-114.
3. С.В. Ковальчук, М.А. Витко, Я. Ли, О.В. Кубряк Когнитивно-ориентированный подход к проектированию гибридных систем поддержки принятия решений для сложных предметных областей // Нелинейная динамика в когнитивных исследованиях — 2025: труды IX Всероссийской конференции, 2025, с. 69-71.
4. О.О. Гофман, А.Ю. Кузьмин, С.В. Ковальчук Симбиотическое взаимодействие «человек – искусственный интеллект» в системах поддержки принятия решений // Организационная психология, 2025, Т. 15, №1, с. 297-321.
5. S.V. Kovalchuk, C. de Mulatier, V.V. Krzhizhanovskaya, L. Franco, M. Paszyński, J. Dongarra, P.M.A. Sloot Computational Science: Guiding the Way Towards a Sustainable Society // Journal of Computational Science, 2025, Vol. 90, pp. 102663.
6. N. Dorzhu, T. Sukhomlinova, L. Luo, S. Kovalchuk Predicting future collaborations in a scientific community using graph neural networks // Lecture Notes in Computer Science, 2025, Vol. 15906, pp. 377-384.
7. A. Ireddy, S. Kovalchuk Simulation Modelling of Clinical Decision making for Personalized Policy Identification // Lecture Notes in Computer Science, 2025, Vol. 15906, pp. 412-420.
8. D. Fedrushkov, D. Tereshchenko, A. Aliev, S. Kovalchuk Improving project-level code generation using combined relevant context // Lecture Notes in Computer Science, 2025, Vol. 15906, pp. 438-445.
9. C. Li, D. Zhang, F. Ren, S. Kovalchuk Cross-Scale Modeling of Healthcare Norms and Patient Features Dynamics with Interpretable Machine Learning // Lecture Notes in Computer Science, 2025, Vol. 15908, pp. 113-127.
10. D. Evtyukhov, G. Kopanitsa, O. Metsker, A. Yakovlev, S. Kovalchuk Automatic Detection and Segmentation of Coronary Artery Stenosis in Coronary Angiography Images // Lecture Notes in Computer Science, 2025, Vol. 15908, pp. 128-140.
11. L. Luo, K. Bochenina, T.M. Abuhay, N. Dorzhu, G. Kampis, S. Kovalchuk, V. Krzhizhanovskaya, M. Paszynski, C. de Mulatier, J. Dongarra, P.M.A. Sloot Evolution of the computational science community: The dynamics of topics and collaborations in 24 years of ICCS and JoCS publications // Journal of Computational Science, 2025, Vol. 89, pp. 102609.
12. C. Li, O. Petruchik, E. Grishanina, S. Kovalchuk Multi-agent norm perception and induction in distributed healthcare // Journal of Biomedical Informatics, Vol. 166, 2025, pp. 104835.
13. X. Fu, V. Krzhizhanovskaya, A. Yakovlev, S. Kovalchuk Modelling Diversity in Hospital Strategies in City-Scale Ambulance Dispatching with Coupled Game-Theoretic Model and Discrete-Event Simulation // Journal of Biomedical Informatics, 2025, Vol. 162, pp. 104777.
14. I. Moiseev, K. Balabaeva, S. Kovalchuk Open and Extensible Benchmark for Explainable Artificial Intelligence Methods // Algorithms, 2025, Vol. 18, No. 2, pp. 85.
15. A. Pimenov, S. Kovalchuk Evaluation and prediction of human software developers' perception of large language model suggestions using GitHub data // Lecture Notes in Computer Science, 2025, Vol. 15406, pp. 347-361.
16. A.T.S. Ireddy, M.V. Ionov, L.A. Beloglazov, E.A. Zatsepina, S.V. Kovalchuk Evaluating Perceived Complexity of Process Models from a Targeted Survey of Healthcare Domain Specialists // Communications in Computer and Information Science, 2025, Vol. 2363, pp. 43-58.
17. Д.А. Шлемин, О.В. Кубряк, С.В. Ковальчук Математическая модель малоразмерной надводной беспилотной платформы // Всероссийская молодежная конференция «Научно-технологическое развитие судостроения – 2025»: тезисы докладов, 2025, с. 72-73.

2024

18. О.В. Кубряк, С.В. Ковальчук Искусственный сенсорный компонент в системе человек-машина с комбинированной обратной связью // Проблемы управления, 2024, №6, с. 27-37.
19. S.V. Kovalchuk, C. Li, O.V. Kubryak Towards Explaining Emergent Behavior in Multi-Agent Systems Micro-Parameter Space Structuring with Feature Importance in Heatbug Model // 2024 IEEE/WIC International Conference on Web Intelligence and Intelligent Agent Technology (WI-IAT), 2024, pp. 824-829.
20. D. Fedrushkov, S. Kovalchuk, V. Lomshakov, A. Aliev Beam Search for Improvement of Code Generation in Answering Programming Questions with Code // Communications in Computer and Information Science, 2024, Vol. 2241, pp. 194-208.
21. A.V. Gorbatovski, A.D. Razin, A.A. Aliev, S.V. Kovalchuk Improving question answering in programming domain with pretrained language model finetuning using structured diverse online forum data // Scientific and Technical Journal of Information Technologies, Mechanics and Optics, 2024, vol. 24, no. 6, pp. 1024-1034.
22. D. Pogrebnoi, A. Funkner, S. Kovalchuk RuMedSpellchecker: a new approach for advanced spelling error correction in Russian electronic health records // Journal of Computational Science, 2024, Vol. 82, pp. 102393.
23. S.V. Kovalchuk, C. de Mulatier, V.V. Krzhizhanovskaya, J. Mikyška, M. Paszyński, J. Dongarra, P.M.A. Sloot Computation at the Cutting Edge of Science // Journal of Computational Science, 2024, Vol. 81, pp. 102379.
24. C. Li, O. Petruchik, E. Grishanina, S. Kovalchuk Modelling of practice sharing in complex distributed healthcare system // Lecture Notes in Computer Science, Vol. 14835, 2024, pp. 224-238.
25. A.T.S. Ireddy, S.V. Kovalchuk Modelling information perceiving within clinical decision support using inverse reinforcement learning // Lecture Notes in Computer Science, Vol. 14835, 2024, pp. 210-223.
26. L. Luo, S. Kovalchuk, V. Krzhizhanovskaya, M. Paszynski, J. Dongarra, P. Sloot Trends in computational science: natural language processing and network analysis of 23 years of ICCS publications // Lecture Notes in Computer Science, Vol. 14833, 2024, pp. 19-33.
27. С.В. Ковальчук, А.Т.Ш. Иредди Моделирование индивидуальных когнитивных состояний оператора в рамках взаимодействия человек-искусственный интеллект при работе с системами поддержки принятия решений в сложных предметных областях // Десятая международная конференция по когнитивной науке: Тезисы докладов. Пятигорск, 26–30 июня 2024 г. В двух частях. Часть I, 2024, с. 147-149.
28. S. Kovalchuk, A.T.S. Ireddy Prediction of Users Perceptional State for Human-Centric Decision Support Systems in Complex Domains through Implicit Cognitive State Modeling // Proceedings of the Annual Meeting of the Cognitive Science Society, 2024, Vol. 46, pp. 3257-3264.
29. А.Н. Солдатов, И.К. Солдатов, С.В. Ковальчук Моделирование восприятия рекомендаций системы поддержки принятия врачебных решений на основе предсказательного моделирования при проведении профилактических осмотров врачами-стоматологами // Научно-технический вестник информационных технологий, механики и оптики, 2024, Т. 24, №2, с. 335-338.
30. A. Gorbatovski, S. Kovalchuk Reinforcement Learning for Question Answering in Programming Domain using Public Community Scoring as a Human Feedback // Proceedings of the 23rd International Conference on Autonomous Agents and Multiagent Systems, 2024, pp. 2294-2296.

2023

31. T. Isakov, S. Kovalchuk Methodology of event extraction from unstructured medical texts on the example of the Russian language // Procedia Computer Science, 2023, Vol. 229, pp. 101-108.
32. I. Babikov, S. Kovalchuk, I. Soldatov Semi-supervised method for improving text data labels // Procedia Computer Science, 2023, Vol. 229, pp. 168-176.
33. E. Zhdanova, I. Korneyev, S. Kovalchuk Predictive modeling of multistep clinical pathways: application to infertility treatment process // Procedia Computer Science, 2023, Vol. 229, pp. 272-283.
34. O.V. Kubryak, S.V. Kovalchuk, N.G. Bagdasaryan Assessment of Cognitive Behavioral Characteristics in Intelligent Systems with Predictive Ability and Computing Power // Philosophies, 2023, Vol. 8, No. 5, pp. 75.
35. S.V. Kovalchuk, C. de Mulatier, D. Groen, M. Paszyński, V. V. Krzhizhanovskaya, J. Dongarra, P.M.A. Sloot The Computational Planet // Journal of Computational Science, 2023, Vol. 72, pp. 102102.
36. A. Gorbatovski, S. Kovalchuk Bayesian Networks for Named Entity Prediction in Programming Community Question Answering // Lecture Notes in Computer Science, Vol. 14074, 2023, pp. 282-289.
37. D. Pogrebnoy, A. Funkner, S. Kovalchuck RuMedSpellchecker: correcting spelling errors for natural Russian language in electronic health records using machine learning techniques // Lecture Notes in Computer Science, Vol. 10475, 2023, Vol. 213-227.
38. L. Rvanova, S. Kovalchuk Automatic structuring of topics for natural language generation in community question answering in programming domain // Lecture Notes in Computer Science, Vol. 14074, 2023, pp. 322-329.
39. V. Lomshakov, S. Kovalchuk, S. Nikolenko, A. Aliev Fine-Tuning Large Language Models for Answering Programming Questions with Code Snippets // Lecture Notes in Computer Science, Vol. 14074, 2023, pp. 171-179.
40. G. Kopanitsa, O. Metsker, S. Kovalchuk Machine Learning Methods for Pregnancy and Childbirth Risk Management // Journal of Personalized Medicine, 2023, Vol. 13, No. 6, pp. 975.
41. A.T.S. Ireddy, S.V. Kovalchuk An Experimental Outlook on Quality Metrics for Process Modelling: A Systematic Review and Meta Analysis // Algorithms, 2023, Vol. 16, No. 6, pp. 295.
42. T.M. Abuhay, S. Robinson, A. Mamuye, S.V. Kovalchuk Machine learning integrated patient flow simulation: why and how? // Journal of Simulation, Vol. 0, 2023, pp. 1-14.
43. S. Kovalchuk, D. Fedrushkov, V. Lomshakov, A. Aliev Test-based and metric-based evaluation of code generation models for practical question answering // International Conference on Code Quality (ICCQ), 2023, pp. 73-86.
44. M. Kabyshev, S. Kovalchuk Analysis and control of user engagement in personalized mobile assisting software for chronic disease patients // Scientific and Technical Journal of Information Technologies, Mechanics and Optics, Vol. 23, No. 2, 2023, pp. 331-339.
45. L.O. Elkhovskaya, A.D. Kshenin, M.A. Balakhontceva, M.V. Ionov, S.V. Kovalchuk Extending Process Discovery with Model Complexity Optimization and Cyclic States Identification: Application to Healthcare Processes // Algorithms, 2023, Vol. 16, No. 1, pp. 57.
46. И.К. Солдатов, Г.А. Гребнев, С.В. Ковальчук Способ генерализованного представления научной информации в области «стоматологии» в цифровом формате для анализа данных // Усовершенствование способов и аппаратуры, применяемых в учебном процессе, медико-биологических исследованиях и клинической практике: Сборник изобретений и рационализаторских предложений, 2023, №54, С. 124-125.
47. И.К. Солдатов, Г.А. Гребнев, С.В. Ковальчук Электронная карта оценки стоматологического здоровья воспитанников общеобразовательных организаций министерства обороны российской федерации // Усовершенствование способов и аппаратуры, применяемых в учебном процессе, медико-биологических исследованиях и клинической практике: Сборник изобретений и рационализаторских предложений, 2023, №54, С. 128-130.
48. L. Rvanova, S.V. Kovalchuk Using regular expressions for thematic classification in the task of question answering // XII Конгресс молодых ученых. Сборник научных трудов. Том 4. Часть 1, 2023, с. 57-59.

2022

49. S. Kovalchuk, V. Lomshakov, A. Aliev Human perceiving behavior modeling in evaluation of code generation models // Proceedings of the 2nd Workshop on Natural Language Generation, Evaluation, and Metrics (GEM), 2022, pp. 287-294.
50. A.D. Rezvykh, A.P. Ovcharenko, R.N. Lemeshkin, S.V. Kovalchuk Modeling the workflow of a field hospital in earthquake conditions // Procedia Computer Science, Vol. 212, 2022, pp. 330-339.
51. N. Detkov, K. Balabaeva, S. Kovalchuk Exploring the relationship between error and interpretation of the segmentation model’s prediction // Procedia Computer Science, Vol. 212, 2022, pp. 122-131.
52. I. Babikov, S. Kovalchuk, I. Soldatov, G. Grebnev Structuring Research Directions in Medical Domain with Topic Modelling: application for PhD Theses Synopses in Dentistry // Studies in Health Technology and Informatics, Vol. 299, 2022, pp. 229-234.
53. G. Kopanitsa, S. Kovalchuk Study of the User Behaviour Caused by Automatic Recommendation Systems Call to Action // Studies in Health Technology and Informatics, Vol. 299, 2022, pp. 89-96.
54. I.V. Derevitskii, N.D. Mramorov, S.D. Usoltsev, S.V. Kovalchuk Hybrid Bayesian Network-Based modeling: COVID-pneumonia case // Journal of Personalized Medicine, Vol. 12, No. 8, 2022, pp. 1325.
55. V.V. Pavlovskii, I.V. Derevitskii, S.V. Kovalchuk Hybrid Genetic Predictive Modeling for Finding Optimal Multipurpose Multicomponent Therapy // Journal of Computational Science, Vol. 62, 2022, pp. 101772.
56. K. Balabaeva, S. Kovalchuk Neural Additive Models for Explainable Heart Attack Prediction // Lecture Notes in Computer Science, Vol. 13352, 2022, pp. 113-121.
57. S.V. Kovalchuk, V.V. Krzhizhanovskaya, M. Paszyński, D. Kranzlmüller, J. Dongarra, P.M.A. Sloot Computational Science for a Better Future // Journal of Computational Science, Vol. 62, 2022, pp. 101745.
58. G. Kopanitsa, S. Kovalchuk Study of the user behaviour caused by automatic symptom checkers call to action // Proceedings of the 15th International Joint Conference on Biomedical Engineering Systems and Technologies – HEALTHINF, 2022, pp. 499-503.
59. L. Elkhovskaya, S. Kovalchuk, I. Potapov, D. Ovchinnikov COVID-19 Treatment Process Identification: A Case Study in Russian Hospital for Cardiology // Proceedings of the 15th International Joint Conference on Biomedical Engineering Systems and Technologies – HEALTHINF, 2022, pp. 755-765.
60. М.В. Ионов, Е.В. Болгова, Н.Э. Звартау, Н.Г. Авдонина, М.А. Балахонцева, С.В. Ковальчук, А.О. Конради Внедрение системы поддержки принятия решений для повышения качества медицинских данных пациентов с артериальной гипертензией // Научно-технический вестник информационных технологий, механики и оптики. 2022. Т. 22, No 1. С. 217–222.
61. S.V. Kovalchuk, G.D. Kopanitsa, I.V. Derevitskii, G.A. Matveev, D.A. Savitskaya Three-stage intelligent support of clinical decision making for higher trust, validity, and explainability // Journal of Biomedical Informatics, Vol. 127, 2022, pp. 104013.
62. A.A. Funkner, A.N. Yakovlev, S.V. Kovalchuk Surrogate-assisted performance tuning of knowledge discovery algorithms: application to clinical pathway evolutionary modeling // Journal of Computational Science, Vol. 59, 2022, pp. 101562.
63. V. Koshman, A. Funkner, S. Kovalchuk An Unsupervised Approach to Structuring and Analyzing Repetitive Semantic Structures in Free Text of Electronic Medical Records // Journal of Personalized Medicine, Vol. 12, No. 1, 2022, pp. 25.
64. А.В. Чижик, С.А. Мельникова, С.В. Ковальчук Приложения мобильного здравоохранения: исследование мотивации русскоговорящих пользователей // Альманах научных работ молодых ученых Университета ИТМО, Том 2, 2022, с. 396-401.

2021

65. A.A. Funkner, D.A. Zhurman, S.V. Kovalchuk Extraction of Temporal Structures for Clinical Events in Unlabeled Free-text Electronic Health Records in Russian // Studies in Health Technology and Informatics, Vol. 287, 2021, pp. 55-56.
66. G. Kopanitsa, I.V. Derevitskii, D.A. Savitskaya, S.V. Kovalchuk Assessing Acceptance Level of a Hybrid Clinical Decision Support Systems // Studies in Health Technology and Informatics, Vol. 287, 2021, pp. 18-22.
67. V. Koshman, A. Funkner, S. Kovalchuk An unsupervised approach to structuring and analyzing repetitive semantic structures in free text of electronic medical records // Studies in Health Technology and Informatics, Vol. 285, 2021, pp. 94-99.
68. N. Mramorov, I. Derevitskii, S. Kovalchuk Predictive modeling of COVID and non-COVID pneumonia trajectories // Studies in Health Technology and Informatics, Vol. 285, 2021, pp. 112-117.
69. A. Kanonirov, K. Balabaeva, S. Kovalchuk Statistical inference for clustering results interpretation in clinical practice // Studies in Health Technology and Informatics, Vol. 285, 2021, pp. 100-105.
70. A. Kshenin, S. Kovalchuk Data-driven Modelling of Complex Business Process in Heterogeneous Environment of Healthcare Organization with Health Information Systems // Studies in Health Technology and Informatics, Vol. 285, 2021, pp. 118-123.
71. S. Milykh, S. Kovalchuk Treatment trajectories graph compression algorithm based on cliques // Studies in Health Technology and Informatics, Vol. 285, 2021, pp. 300-305.
72. G. Kopanitsa, O. Metsker, E. Bolgova, S. Kovalchuk Lifestyle Cancer Survival Predictors: Influence of Vegetarian Diet on the Relapse of Endometrial Cancer // Studies in Health Technology and Informatics, Vol. 285, 2021, pp. 193-198.
73. K. Nikolaeva, L. Elkhovskaya, S. Kovalchuk Patient measurements simulation and event processing in telemedicine systems // Procedia Computer Science, Vol. 193, 2021, pp. 122-130.
74. A. Funkner, M. Egorov, S. Fokin, G. Orlov, S. Kovalchuk Citywide quality of health information system through text mining of electronic health records // Applied Network Science, Vol. 6, 2021, pp. 53.
75. D.A. Ponomartseva, I.V. Derevitskii, S.V. Kovalchuk, A.Y. Babenko Prediction model for thyrotoxic atrial fibrillation: a retrospective study // BMC Endocrine Disorders, Vol. 21, 2021, pp. 150.
76. I.V. Derevitskii, D.A. Savitskaya, A.Y. Babenko, S.V. Kovalchuk Hybrid predictive modelling: Thyrotoxic atrial fibrillation case // Journal of Computational Science, Vol. 51, 2021, pp. 101365.
77. S.V. Kovalchuk, V.V. Krzhizhanovskaya, M. Paszyński, G. Závodszky, M.H. Lees, J. Dongarra, P.M.A.Sloot 20 years of computational science: Selected papers from 2020 International Conference on Computational Science // Journal of Computational Science, Vol. 53, 2021, pp. 101395.
78. K. Balabaeva, S. Kovalchuk Clustering Results Interpretation of Continuous Variables Using Bayesian Inference // Studies in Health Technology and Informatics, Vol. 281, pp. 477-481.
79. L. Elkhovskaya, S. Kovalchuk Feature Engineering with Process Mining Technique for Patient State Predictions // Lecture Notes in Computer Science, Vol. 12744, 2021, pp. 584-592.
80. K. Balabaeva, S. Kovalchuk Comparison of Efficiency, Stability and Interpretability of Feature Selection Methods for Multiclassification Task on Medical Tabular Data // Lecture Notes in Computer Science, Vol. 12744, 2021, pp. 623-633.
81. I. Derevitskii, V. Pavlovskii, S. Kovalchuk Hybrid Predictive Modelling for Finding Optimal Multipurpose Multicomponent Therapy // Lecture Notes in Computer Science, Vol. 12744, 2021, pp. 479-493.
82. T.M. Abuhay, A.L. Mamuye, S. Robinson, S.V. Kovalchuk Why Machine Learning Integrated Patient Flow Simulation? // Proceedings of the Operational Research Society Simulation Workshop 2021 (SW21), 2021, pp. 375-384.

2020

83. V. Guleva, E. Shikov , K. Bochenina, S. Kovalchuk, A. Alodjants, A. Boukhanovsky Emerging Complexity in Distributed Intelligent Systems // Entropy, Vol. 22, Issue 12, 2020, pp. 1437.
84. I. Derevitskii, S. Kovalchuk Machine Learning-Based Predictive Modeling of Complications of Chronic Diabetes // Procedia Computer Science, Vol. 178, 2020, pp. 274-283.
85. K. Balabaeva, S. Kovalchuk Post-hoc Interpretation of Patients Clustering Using Bayesian Inference // Procedia Computer Science, Vol. 178, 2020, pp. 264-273.
86. K. Balabaeva, L. Akmadieva, S. Kovalchuk Optimal Wells Placement to Maximize the Field Coverage Using Derivative-Free Optimization // Procedia Computer Science, Vol. 178, 2020, pp. 65–74.
87. O. Metsker, K. Magoev, A. Yakovlev, S. Yanishevskiy, G. Kopanitsa, S. Kovalchuk, V.V. Krzhizhanovskaya Identification of risk factors for patients with diabetes: diabetic polyneuropathy case study // BMC Medical Informatics and Decision Making, Vol. 20, 2020, pp. 201.
88. O. Metsker, G. Kopanitsa, A. Yakovlev, A. Ilin, S. Kovalchuk Echocardiography Population Study in Russian Federation Using Machine Learning // European Journal for Biomedical Informatics, Vol. 6, Issue 2, 2020, pp. 43-48.
89. N. Bukhanov, P. Trudkov, E. Vinogradova, I. Derevitskii, K. Balabaeva, A. Funkner and S. Kovalchuk Computational approach for data-driven mining of upstream value-added structures // EAGE/AAPG Digital Subsurface for Asia Pacific Conference, Sep 2020, Vol. 2020, p.1-5.
90. S.V. Kovalchuk, V.V. Krzhizhanovskaya, P.M.A. Sloot 20 Years of Computational Science // Journal of Computational Science, Vol. 46, 2020, pp. 101187.
91. I.V. Derevitskii, S.V. Kovalchuk Machine Learning-Based Factor Analysis of Carbohydrate Metabolism Compensation for TDM2 Patients // Studies in Health Technology and Informatics, Vol. 273, 2020, pp. 123-128.
92. T.M. Abuhay, O.G. Metsker, A.N. Yakovlev, S. V. Kovalchuk Constructing Holistic Patient Flow Simulation Using System Approach // Lecture Notes in Computer Science, Vol. 12140, 2020, pp. 418–429.
93. T.M. Abuhay, Y.G. Nigatie, O.G. Metsker, A.N. Yakovlev, S.V. Kovalchuk Investigating Coordination of Hospital Departments in Delivering Healthcare for Acute Coronary Syndrome Patients Using Data-Driven Network Analysis // Lecture Notes in Computer Science, Vol. 12140, 2020, pp. 430–440.
94. K. Balabaeva, S. Kovalchuk Experiencer Detection and Automated Extraction of a Family Disease Tree from Medical Texts in Russian Language // Lecture Notes in Computer Science, Vol. 12140, 2020, pp. 603–612.
95. I. V Derevitskii, D.A. Savitskaya, A.Y. Babenko, S. V. Kovalchuk The Atrial Fibrillation Risk Score for Hyperthyroidism Patients // Lecture Notes in Computer Science, Vol. 12140, 2020, pp. 495–508.
96. A.A. Funkner, S. V. Kovalchuk Time Expressions Identification Without Human-Labeled Corpus for Clinical Text Mining in Russian // Lecture Notes in Computer Science, Vol. 12140, 2020, pp. 591–602.
97. S. V. Kovalchuk, A.A. Funkner, K.Y. Balabaeva, I. V. Derevitskii, V. V. Fonin, N. V. Bukhanov Towards Modeling of Information Processing Within Business-Processes of Service-Providing Organizations // Lecture Notes in Computer Science, Vol. 12137, 2020, pp. 667–675.
98. A. Funkner, K. Balabaeva, S. Kovalchuk Negation Detection for Clinical Text Mining in Russian // Studies in Health Technology and Informatics, Vol. 270, 2020, pp. 342-346.
99. K. Balabaeva, A. Funkner, S. Kovalchuk Automated Spelling Correction for Clinical Text Mining in Russian // Studies in Health Technology and Informatics, Vol. 270, 2020, pp. 43-47.
100. V.N. Leonenko, S.V. Kovalchuk Analyzing the spatial distribution of individuals predisposed to arterial hypertension in Saint Petersburg using synthetic populations // ITM Web of Conferences, Vol. 31, 2020, pp. 03002.
101. E.V. Bolgova, S.V. Kovalchuk, M.A. Balakhontceva, N.E. Zvartau, O.G. Metsker Human Computer Interaction During Clinical Decision Support With Electronic Health Records Improvement // International Journal of E-Health and Medical Communications, Vol. 11, Issue 1, 2020, pp. 93-106.
102. А.В. Бухановский, С.В. Иванов, С.В. Ковальчук, Ю.И. Нечаев Онтологическая система знаний и вычислительных ресурсов современных интеллектуальных технологий // Онтология проектирования. – 2020. – Т.10, №1(35). – С.22-33.

2019

103. Y.I. Mikhailov, A.G. Budrin, E.V. Budrina, S.V. Kovalchuk, A.V. Soldatova. R.N. Lemeshkin Informational Support of Automated Quality Management Systems for Medical Service Provision Based on the Prognosis of the Patient Affects Outcome in Social Emergencies // 2019 International Conference "Quality Management, Transport and Information Security, Information Technologies" (IT&QM&IS), Sochi, Russia, 2019, pp. 284-287.
104. S.V. Kovalchuk, V.V. Krzhizhanovskaya, Y. Shi, H. Fu, M.H. Lees, J. Dongarra, P.M.A. Sloot Science at the Intersection of Data, Modelling, and Computation // Journal of Computational Science, Vol. 34, 2019, pp. 117-119.
105. K. Balabaeva, S. Kovalchuk Comparison of Temporal and Non-Temporal Features Effect on Machine Learning Models Quality and Interpretability for Chronic Heart Failure Patients // Procedia Computer Science, Vol. 156, 2019, pp. 87-96.
106. A.A. Funkner, N.E. Zvartau, S.V. Kovalchuk Motif identification in vital signs of chronic patients // Procedia Computer Science, Vol. 156, 2019, pp. 105-113.
107. I.V. Derevitskii, S.V. Kovalchuk Analysis course of the disease of type 2 diabetes patients using Markov chains and clustering methods // Procedia Computer Science, Vol. 156, 2019, pp. 114-122.
108. M.V. Kabyshev, S.V. Kovalchuk Development of personalized mobile assistant for chronic disease patients: diabetes mellitus case study // Procedia Computer Science, Vol. 156, 2019, pp. 123-133.
109. O. Metsker, A. Yakovlev, S. Kovalchuk, S. Kesarev, E. Bolgova, K. Golubev, A. Karsakov Modelling and Analysis of Complex Patient-Treatment Process using GraphMiner Toolbox // Lecture Notes in Computer Science, Vol. 11540, 2019, pp. 674-680.
110. N.O. Nikitin, P. Vychuzhanin, A. Hvatov, I. Deeva, A.V. Kalyuzhnaya, S.V. Kovalchuk Deadline-Driven Approach for Multi-Fidelity Surrogate-Assisted Environmental Model Calibration // GECCO '19 Proceedings of the Genetic and Evolutionary Computation Conference Companion, 2019, pp. 1583-1591.
111. L. Elkhovskaya, M. Kabyshev, A. Funkner, M. Balakhontceva, V. Fonin, S. Kovalchuk Personalized Assistance for Patients with Chronic Diseases Through Multi-Level Distributed Healthcare Process Assessment // Studies in Health Technology and Informatics, Vol. 261, 2019, pp. 309-312.
112. K. Balabaeva, S. Kovalchuk, O. Metsker Dynamic Features Impact on the Quality of Chronic Heart Failure Predictive Modelling // Studies in Health Technology and Informatics, Vol. 261, 2019, pp. 179-184.
113. O. Metsker, A. Yakovlev, A. Ilin, S. Kovalchuk Echocardiography Population Study in Russian Federation for 4P Medicine Using Machine Learning // Studies in Health Technology and Informatics, Vol. 261, 2019, pp. 137-142.
114. I. Derevitskii, A. Funkner, O. Metsker, S. Kovalchuk Graph-Based Predictive Modelling of Chronic Disease Development: Type 2 DM Case Study // Studies in Health Technology and Informatics, Vol. 261, 2019, pp. 150-155.
115. O. Metsker, E. Trofimov, S. Sikorskiy and S. Kovalchuk Text and Data Mining Techniques in Judgment Open Data Analysis for Administrative Practice Control // Communications in Computer and Information Science, Vol. 947, 2019, pp. 169-180.
116. O.G. Metsker, S.A. Sikorskiy, A.A. Semakova, A.V. Krikunov, M.A. Balakhontceva, N.B. Melnikova, S.V. Kovalchuk Holistic Monitoring and Analysis of Healthcare Processes through Public Internet Data Collection // Lecture Notes in Computer Science, Vol. 11551, 2019, pp. 42-50.
117. M. Ionov, N. Zvartau, A. Semakova, E. Bolgova, S. Kovalchuk, A. Boukhanovsky, A. Konradi Response rate and patients characteristics associated with effective antihypertensive monotherapy // Journal of Hypertension, Vol. 37, e-Supplement 1, 2019, pp. e105-e105.

2018

118. S.V. Kovalchuk, O.G. Metsker, A.A. Funkner, I.O. Kisliakovskii, N.O. Nikitin, A.V. Kalyuzhnaya, D.A. Vaganov, K.O. Bochenina A Conceptual Approach to Complex Model Management with Generalized Modelling Patterns and Evolutionary Identification // Complexity, Volume 2018, Article ID 5870987, 15 p.
119. Семакова А.А., Звартау Н.Э., Ковальчук С.В., Бухановский А.В. Многомасштабное популяционное моделирование процессов развития и лечения артериальной гипертензии // Известия высших учебных заведений. Приборостроение. – 2018. – Т. 61. – № 10. – С. 922–929.
120. Т.М. Абухай, С.В. Ковальчук, М.А. Балахонцева, А.В. Бухановский Моделирование, анализ и прогнозирование процессов оказания кардиологической помощи в стационаре // Известия высших учебных заведений. Приборостроение, №8 (61), 2018, с. 730-733.
121. M.A. Balakhontceva, A.A. Funkner, A.A. Semakova, O.G. Metsker, N.E. Zvartau, A.N. Yakovlev, A.E. Lutsenko and S.V. Kovalchuk Holistic Modeling of Chronic Diseases for Recommendation Elaboration and Decision Making // Procedia Computer Science, Vol. 138, 2018, pp. 228-237.
122. O. Metsker, A. Yakovlev, E. Bolgova, A. Vasin, S. Kovalchuk Identification of Pathophysiological Subclinical Variances During Complex Treatment Process in Cardiovascular Patients // Procedia Computer Science, Vol. 138, 2018, pp. 161-168.
123. O. Metsker, S. Sikorskiy, A. Yakovlev, S. Kovalchuk Dynamic mortality prediction using machine learning techniques for acute cardiovascular cases // Procedia Computer Science, Vol. 136, 2018, pp. 351-358.
124. T.M. Abuhay, Y.G. Nigatie, O.G. Metsker, S.V. Kovalchuk Investigating Application of Change Point Analysis in Monitoring Health Condition of Acute Coronary Syndrome Patients // Procedia Computer Science, Vol. 136, 2018, pp. 408-415.
125. K. Magoev, V.V. Krzhizhanovskaya, S.V. Kovalchuk Application of clustering methods for detecting critical acute coronary syndrome patients // Procedia Computer Science, Vol. 136, 2018, pp. 370-379.
126. X. Fu, A. Presbitero, S.V. Kovalchuk, V.V. Krzhizhanovskaya Coupling Game Theory and Discrete-Event Simulation for Model-Based Ambulance Dispatching // Procedia Computer Science, Vol. 136, 2018, pp. 398-407.
127. T.M Abuhay, Y.G. Nigatie, S.V. Kovalchuk Towards Predicting Trend of Scientific Research Topics using Topic Modeling // Procedia Computer Science, Vol. 136, 2018, pp. 304-310.
128. D. Vaganov, A. Funkner, S. Kovalchuk, V. Guleva, K. Bochenina Forecasting purchase categories with transition graphs using financial and social data // Lecture Notes in Computer Science, Vol. 11185, 2018, pp. 439-454.
129. N. Zvartau, A. Semakova, E. Bolgova, S. Kovalchuk, A. Boukhanovsky, A. Konradi Prediction of Blood Pressure-Lowering Efficacy of Antihupertensive Treatment Depending on Individual Patient Characteristics: Initial Model // Journal of Hypertension, Vol. 36, e-Supplement 1, 2018, pp. e21-e21.
130. S.V. Kovalchuk, A.A. Funkner, O.G. Metsker, A.N. Yakovlev Simulation of Patient Flow in Multiple Healthcare Units using Process and Data Mining Techniques for Model Identification // Journal of Biomedical Informatics, Vol. 82, 2018, pp. 128-142.
131. S.V. Kovalchuk, M.A. Moskalenko, A.N. Yakovlev Towards Model-based Policy Elaboration on City Scale using Game Theory: Application to Ambulance Dispatching // Lecture Notes in Computer Science, Vol. 10860, 2018, pp. 404-417.
132. S. Sikorskiy, O. Metsker, A. Yakovlev, S. Kovalchuk Machine Learning Based Text Mining in Electronic Health Records: Cardiovascular Patient Cases // Lecture Notes in Computer Science, Vol. 10862, 2018, pp. 818-824.
133. S.V. Kovalchuk, O.G. Metsker, A.A. Funkner, I.O. Kisliakovskii, N.O. Nikitin, A.V. Kalyuzhnaya, D.A. Vaganov, K.O. Bochenina Towards Management of Complex Modeling through a Hybrid Evolutionary Identification // GECCO '18 Proceedings of the Genetic and Evolutionary Computation Conference Companion, 2018, pp. 255-256.
134. М.А. Балахонцева, С.В. Ковальчук, М.А. Ховричев, И.О. Кисляковский Интеллектуальная интеграция разнородных источников данных в задачах медицины и здравоохранения // Международная конференция по мягким вычислениям и измерениям, Т. 2, 2018, с. 31-33.
135. N. Butakov, M. Petrov, K. Mukhina, D. Nasonov, S. Kovalchuk Unified domain-specific language for collecting and processing data of social media // Journal of Intelligent Information Systems, Vol. 51, Issue 2, 2018, pp. 389-414.
136. S.V. Kovalchuk, V.V. Krzhizhanovskaya, P. Koumoutsakos, E. Chatzi, M.H. Lees, J. Dongarra, P.M.A. Sloot The Art of Computational Science: Bridging Gaps – Forming Alloys // Journal of Computational Science, Vol. 26, 2018, pp. 190-192.
137. T.M. Abuhay, S.V. Kovalchuk, K. Bochenina, G.-K. Mbogo, A.A. Visheratin, G. Kampis, V. V. Krzhizhanovskaya, M.H. Lees Analysis of Publication Activity of Computational Science Society in 2001-2017 Using Topic Modeling and Graph Theory // Journal of Computational Science, Vol. 26, 2018, pp. 193-204.
138. A. Yakovlev, O. Metsker, S. Kovalchuk, E. Bolgova Prediction of In-Hospital Mortality and Length of Stay in Acute Coronary Syndrome Patients Using Machine Learning Methods // Journal of the American College of Cardiology, Vol. 71, Issue 11 Supplement, 2018, p. A242.
139. S.V. Kovalchuk, E. Krotov, P.A. Smirnov, D.A. Nasonov, A.N. Yakovlev Distributed Data-Driven Platform for Urgent Decision Making in Cardiological Ambulance Control // Future Generation Computer Systems, Vol. 79, Part 1, 2018, pp. 144-154.
140. Р.Н. Лемешкин, И.Ф. Савченко, И.Ф. Латыпов, А.А. Жуков, А.В. Крикунов, С.В. Ковальчук, М.А. Балахонцева Имитационное моделирование – инструмент научного изучения организации медицинского обеспечения войск (сил) в военных конфликтах и чрезвычайных ситуациях мирного времени // Медицина катастроф, №2 (102), 2018, сс. 5-10.
141. А.Е. Онищук, С.В. Ковальчук Предсказательное моделирование течения и исходов хронических неинфекционных заболеваний с учетом персонификации путей течения с использованием методов машинного обучения // Альманах научных работ молодых ученых Университета ИТМО, Том 2, 2018, с. 131-134.

2017

142. O. Metsker, E. Bolgova, A. Yakovlev, A. Funkner, S. Kovalchuk Pattern-based Mining in Electronic Health Records for Complex Clinical Process Analysis // Procedia Computer Science, Vol. 219, 2017, pp. 196-205.
143. I. Kisliakovskii, M. Balakhontceva, S. Kovalchuk, N. Zvartau, A. Konradi Towards a Simulation Framework for Decision Support in Healthcare Quality Assessment // Procedia Computer Science, Vol. 219, 2017, pp. 206-213.
144. A. Funkner, A. Yakovlev, S. Kovalchuk Towards Evolutionary Discovery of Typical Clinical Pathways in Electronic Health Records // Procedia Computer Science, Vol. 219, 2017, pp. 233-243.
145. I. Palomares, S.V. Kovalchuk Multi-View Data approaches in Recommender Systems: an Overview // Procedia Computer Science, Vol. 219, 2017, pp. 30-41.
146. E.V. Bolgva, N.E. Zvartaua, S.V. Kovalchuk, M.A. Balakhontceva, O.G. Metsker Improving Electronic Medical Records with Support of Human Computer Interaction in Medical Information Systems // Procedia Computer Science, Vol. 121, 2017, pp. 469-474.
147. N. Bukhanov, M. Balakhontceva, S. Kovalchuk, N. Zvartau, A. Konradi Multiscale modeling of comorbidity relations in hypertensive outpatients // Procedia Computer Science, Vol. 121, 2017, pp. 446-450.
148. A.A. Funkner, A.N. Yakovlev, S.V. Kovalchuk Data-driven modeling of clinical pathways using electronic health records // Procedia Computer Science, Vol. 121, 2017, pp. 835-842.
149. S.V. Kovalchuk, T.M. Abuhay, I. Altintas, M.L. Norman, M.H. Lees, V.V. Krzhizhanovskaya, J. Dongarra, P.M.A. Sloot Data through the Computational Lens // Journal of Computational Science, Vol. 20, 2017, pp. 81-84.
150. I. Derevitskiy, E. Krotov, D. Voloshin, A. Yakovlev, S.V. Kovalchuk, V. Karbovskii Simulation of emergency care for patients with ACS in Saint Petersburg for ambulance decision making // Procedia Computer Science, Vol. 108, 2017, pp. 2210-2219.
151. T. Abuhay, S. Kovalchuk, K. Bochenina, G. Kampis, V. Krzhizhanovskaya, M. Lees Analysis of Computational Science Papers from ICCS 2001-2016 using Topic Modeling and Graph Theory // Procedia Computer Science, Vol. 108, 2017, pp. 1-17.
     arXiv:1705.02203
152. N. Zvartau, A. Krikunov, A. Semakova, E. Bolgova, S. Kovalchuk, A. Boukhanovsky, A. Konradi Six-Year Trends in Antyhypertensive Monotherapy and Blood Pressure Control in Patients Referred to Specialized Cardiological Centre // Journal of Hypertension, Vol. 35, e-Supplement 2, 2017, pp. e102-e102.
153. N. Zvartau, A. Krikunov, A. Semakova, E. Bolgova, S. Kovalchuk, A. Boukhanovsky, A. Konradi Antihypertensive Treatment in Routine Clinical Practice of Specialized Cardiological Centre: Six-Year Trends // Journal of Hypertension, Vol. 35, e-Supplement 2, 2017, pp. e93-e93.
154. N. Zvartau, A. Krikunov, A. Semakova, E. Bolgova, S. Kovalchuk, A. Boukhanovsky, A. Konradi Six-year trends in antihypertensive monotherapy: focus on blood pressure control and originals/generics ratio // European Heart Journal, Vol. 38, Issue suppl. 1, 2017, pp. 359-359.
155. A.M. Chirkin, A.S.Z. Belloum, S.V. Kovalchuk, M.X. Makkes, M.A. Melnik, A.A. Visheratin, D.A. Nasonov Execution Time Estimation for Workflow Scheduling // Future Generation Computer Systems, Vol. 75, 2017, pp. 376-387.
156. S.V. Kovalchuk, A.V. Krikunov, K.V. Knyazkov, A.V. Boukhanovsky Classification issues within ensemble-based simulation: application to surge floods forecasting // Stochastic Environmental Research and Risk Assessment, Vol. 31, Issue 5, 2017, pp. 1183-1197.
157. V.V. Kashirin, A.A. Lantseva, S.V. Ivanov, S.V. Kovalchuk, A.V. Boukhanovsky Evolutionary simulation of complex networks’ structures with specific functional properties // Journal of Applied Logic, Volume 24, Part A, 2017, pp. 39-49.
158. А.А. Функнер, А.Н. Яковлев, С.В. Ковальчук Имитационное моделирование нагрузки на группу ключевых отделений специализированного медицинского центра в ходе обслуживания разнородного потока пациентов на примере острого коронарного синдрома // Восьмая всероссийская научно-практическая конференция «Имитационное моделирование. Теория и практика» ИММОД-2017. Труды конференции, 2017, сс. 550-553.
159. S. Kovalchuk, A. Funkner, O. Metsker, A. Yakovlev Data-Driven Modeling and Simulation of Complex Healthcare Environment for P4 Medicine // Исследования по геоинформатике: труды Геофизического центра РАН, Т. 5, №1, 2017, с. 144-144.
160. Р.Н. Лемешкин, А.В. Крикунов, С.В. Ковальчук, И.Ф. Савченко Имитационная модель оказания медицинской помощи раненым в медицинском отряде специального назначения в ходе ликвидации медико-санитарных последствий чрезвычайных ситуаций // Медико-биологические и социально-психологические проблемы безопасности в чрезвычайных ситуациях, 2017, № 4, С. 20–33.

2016

161. T.M. Abuhay, A.V. Krikunov, E.V. Bolgova, L.G. Ratova, S.V. Kovalchuk Simulation of Patient Flow and Load of Departments in Specialized Medical Center // Procedia Computer Science, Vol. 101, 2016, pp. 143-151.
162. A. Funkner, S. Kovalchuk, K. Bochenina Preoperational Time Prediction for Percutaneous Coronary Intervention Using Machine Learning Techniques // Procedia Computer Science, Vol. 101, 2016, pp. 172-176.
163. E.V. Bologva, D.I. Prokusheva, A.V. Krikunov, N.E. Zvartau, S.V. Kovalchuk Human-Computer Interaction in Electronic Medical Records: from the Perspectives of Physicians and Data Scientists // Procedia Computer Science, Vol. 100, 2016, pp. 915-920.
164. I.I. Syomov, E.V. Bologva, S.V. Kovalchuk, A.V. Krikunov, O.M. Moiseeva, M.A. Simakova Towards Infrastructure for Knowledge-based Decision Support in Clinical Practice // Procedia Computer Science, Vol. 100, 2016, pp. 907-914.
165. N. Zvartau, A. Krikunov, A. Semakova, E. Bolgova, S. Kovalchuk, A. Boukhanovsky, A. Konradi Five-year trends in specific risk factors in hypertensive patients reffered to specialized cardiological centre // European Heart Journal, Vol. 37, Issue suppl. 1, 2016, pp. 66-67.
166. N. Zvartau, A. Krikunov, A. Semakova, E. Bolgova, S. Kovalchuk, A. Boukhanovsky, A.O. Konradi Five-years Trends in Demographic Characteristics of Hypertensive Patients Referred to Specialized Cardiological Centre: Age and Gender // Journal of Hypertension, Vol 34, e-Supplement 2, 2016, pp. e62-e62.
167. N. Zvartau, A. Krikunov, A. Semakova, E. Bolgova, S. Kovalchuk, A. Boukhanovsky, A. Konradi Prevalence of Diabetes and Lipid Disorders in Hypertension Patients Referred to Specialized Cardiological Centre: Five-years Trends // Journal of Hypertension, Vol 34, e-Supplement 2, 2016, pp. e322-e323.
168. A.V. Krikunov, E.V. Bolgova, E. Krotov, T.M. Abuhay, A.N. Yakovlev, S.V. Kovalchuk Complex data-driven predictive modeling in personalized clinical decision support for Acute Coronary Syndrome episodes // Procedia Computer Science, Vol. 80, Proceedings of the International Conference on Computational Science, ICCS 2016, 2016, pp. 518-529.
169. A.V. Kiselev, V.A. Karbovsky, S.V. Kovalchuk Agent-based modelling using ensemble approach with spatial and temporal composition // Procedia Computer Science, Vol. 80, Proceedings of the International Conference on Computational Science, ICCS 2016, 2016, pp. 530-541.
170. A. Karsakov, A. Moiseev, K. Mukhina, I.N. Ankudinova, M.A. Ignatieva, E. Krotov, V. Karbovskii, S.V. Kovalchuk, A.O. Konradi Toolbox for Visual Explorative Analysis of Complex Temporal Multiscale Contact Networks Dynamics in Healthcare // Procedia Computer Science, Vol. 80, Proceedings of the International Conference on Computational Science, ICCS 2016, 2016, pp. 2107-2118.

2015

171. S.V. Kovalchuk, K.V. Knyazkov, I.I. Syomov, A.N. Yakovlev, A.V. Boukhanovsky Personalized Clinical Decision Support with Complex Hospital-Level Modelling // Procedia Computer Science, Vol. 66, 4th International Young Scientists Conference on Computational Science, 2015, pp. 392-401.
172. A.V. Krikunov, S.V. Kovalchuk Dynamic Selection of Ensemble Members in Multi-Model Hydrometeorological Ensemble Forecasting // Procedia Computer Science, Vol. 66, 4th International Young Scientists Conference on Computational Science, 2015, pp. 220-227.
173. A. Zakharchuk, S. Kovalchuk, D. Nasonov Dynamic Domain-Specific Language for BigData Tasks’ Description // Lecture Notes in Informatics (LNI), Vol. P-246, 2015, pp. 1207-1218.
174. D. Nasonov, A. Visheratin, K. Knyazkov, S. Kovalchuk Interactive e-Science Cyberinfrastructure for Workflow Management Coupled with Big Data Technology // 15^th International Multidisciplinary Scientific Geoconference SGEM 2015, Informatics, Geoinformatics and Remote Sensing, Conference Proceedings, Vol. 1, 2015, pp. 175-182.
175. S.V. Kovalchuk, A.V. Boukhanovsky Towards Ensemble Simulation of Complex Systems // Procedia Computer Science, Vol. 51, Proceedings of the International Conference on Computational Science, ICCS 2015, 2015, pp. 532-541.
176. S.S. Kosukhin, S.V. Kovalchuk, A.V. Boukhanovsky Cloud Technology for Forecasting Accuracy Evaluation of Extreme Metocean Events // Procedia Computer Science, Vol. 51, Proceedings of the International Conference on Computational Science, ICCS 2015, 2015, pp. 2933-2937.

2014

177. А.В. Захарчук, П.А. Смирнов, Д.А. Насонов, С.В. Ковальчук Динамический предметно-ориентированный язык для задач распределенной обработки больших данных в средах облачных вычислений // Высокопроизводительные вычисления на кластерных системах (HPC 2014), Материалы XIV Международной конференции, 2014, С. 182-190.
178. A. Chirkin, A.S.Z. Belloum, S.V. Kovalchuk, M.X. Makkes Execution Time Estimation for Workflow Scheduling // Proceedings of 9th Workshop on Workflows in Support of Large-Scale Science (WORKS 2014), 2014, pp. 1-10.
179. A. Dukhanov, P. Smirnov, M. Karpova, S. Kovalchuk e-Learning Course Design Based on the Virtual Simulation Objects Concept // 8th IEEE International Conference on Application of Information and Communication Technologies – AICT 2014, 2014, pp. 508-513.
180. P.A. Smirnov, S.V. Kovalchuk Linked-data acquisition model for workflow-based computational experiments // Communications in Computer and Information Science, Volume 468, Knowledge Engineering and the Semantic Web, 2014, pp 175-183.
181. S.V. Kovalchuk, A.A. Bezgodov, D.M. Terekhov, A.V. Boukhanovsky Interactive Environment for Affective Visual Analysis of Large Data within Virtual Reality // Proceedings of Science and Information Conference (SAI) 2014, pp. 736-741.
182. P.A. Smirnov, S.V. Kovalchuk Provenance-Based Workflow Composition with Virtual Simulation Objects Technology // 2014 11th International Conference on Fuzzy Systems and Knowledge Discovery (FSKD), 2014, pp. 930-934.
183. A.M. Chirkin, S.V. Kovalchuk Towards Better Workflow Execution Time Estimation // IERI Procedia, Volume 10, Proceedings of FIE-2014, 2014, pp. 216-223.
184. V.V. Kashirin, S.V. Kovalchuk, A.V. Boukhanovsky Evolutionary simulation of complex networks’ structures with specific functional properties // Advances in Intelligent Systems and Computing, Vol. 299, International Joint Conference SOCO’14-CISIS’14-ICEUTE’14, 2014, pp. 63-72
185. S.V. Kovalchuk, A.V. Zakharchuk, J. Liao, S.V. Ivanov, A.V. Boukhanovsky Technology for BigData Analysis Task Description using Domain-Specific Languages // Procedia Computer Science, Vol. 29, Proceedings of the International Conference on Computational Science, ICCS 2014, 2014, pp. 488-498.
     URL: http://arxiv.org/abs/1404.4821
186. P.A. Smirnov, S.V. Kovalchuk, A.V. Dukhanov Domain Ontologies Integration for Virtual Modelling and Simulation Environments // Procedia Computer Science, Vol. 29, Proceedings of the International Conference on Computational Science, ICCS 2014, 2014, pp. 2507-2514.
187. K.V. Knyazkov, S.V. Kovalchuk Modeling and Simulation Framework for Development of Interactive Virtual Environments // Procedia Computer Science, Vol. 29, Proceedings of the International Conference on Computational Science, ICCS 2014, 2014, pp. 332-342.
188. D.A. Nasonov, T.N. Tchurov, A.S. Zagarskih, S.V. Kovalchuk Technological Platform for Complex Processing of Large Data within Early Warning Systems // WIT Transactions on Information and Communication Technologies, Vol. 56, 2014, pp. 625-634.
189. А.В. Бухановский, С.В. Иванов, С.В. Ковальчук, Ю.И. Нечаев Виртуальный полигон контроля транспортных и социальных систем методами теории катастроф в среде «облачной» модели // XVII Международная конференция по мягким вычислениям и измерениям. Сборник докладов, т. 1-2, 2014, с. 254-257.
190. А.В. Бухановский, С.В. Иванов, С.В. Ковальчук, Ю.И. Нечаев Программный комплекс «Виртуальный полигон – центр компетенции», обеспечивающий оперативный контроль чрезвычайных ситуаций в транспортной и социальной среде на основе облачных вычислений и ГРИД-технологий // Материалы 3-й Всероссийской научно-технической конференции "Суперкомпьютерные технологии" (СКТ-2014), Том 2, 2014, С. 197-202.
191. S.V. Kovalchuk, P.A. Smirnov, K.V. Knyazkov, A.S. Zagarskikh, A.V. Boukhanovsky Knowledge-based Expressive Technologies within Cloud Computing Environments // Advances in Intelligent Systems and Computing, Vol. 279, 2014, pp. 1-11.
     URL: http://arxiv.org/abs/1312.7688

2013

192. С.С. Косухин, С.В. Ковальчук, А.В. Бухановский Методы и технологии распределенного вычислительного эксперимента для обеспечения защиты Санкт-Петербурга от наводнений // Динамика сложных систем - XXI век, № 3, т. 7, 2013, с. 22-27.
193. С.В. Ковальчук, А.М. Чиркин, К.В. Князьков Методы построения и использования моделей производительности облачных сервисов // Динамика сложных систем - XXI век, № 3, т. 7, 2013, с. 90-94.
194. С.В. Ковальчук, А.А. Безгодов, Д.М. Терехов, А.В. Бухановский Интерактивная среда визуального анализа и интерпретации комплексных сетей большого объема с учетом особенностей эмоционального состояния оператора // Динамика сложных систем - XXI век, № 3, т. 7, 2013, с. 95-100.
195. С.В. Ковальчук, А.В. Разумовский, А.И. Спивак Предметно-ориентированная технология хранения и обработки больших объемов данных в облачной платформе CLAVIRE // Динамика сложных систем - XXI век, № 3, т. 7, 2013, с. 106-110.
196. P.A. Smirnov, S.V. Kovalchuk, A.V. Boukhanovsky Knowledge-Based Support for Complex Systems Exploration in Distributed Problem Solving Environments // Communications in Computer and Information Science, Vol. 394, Knowledge Engineering and the Semantic Web. Proceedings of 4th International Conference, KESW 2013, 2013, pp. 147-161.
197. S.V. Kovalchuk, D.M. Terekhov, A.A. Bezgodov, A.V. Boukhanovsky Visual Exploration of Complex Network Data Using Affective Brain-Computer Interface // International Journal of Advanced Computer Science and Applications (IJACSA), Vol. 4, No. 7, 2013, pp. 21-27.
198. S.V. Kovalchuk, P.A. Smirnov, S.V. Maryin, T.N. Tchurov, V.A. Karbovskiy Deadline-Driven Resource Management within Urgent Computing Cyberinfrastructure // Procedia Computer Science, Vol. 18, Proceedings of the International Conference on Computational Science, ICCS 2013, 2013, pp. 2203-2212.
199. S.V. Ivanov, S.V. Kovalchuk, A.V. Boukhanovsky Workflow-Based Collaborative Decision Support for Flood Management Systems // Procedia Computer Science, Vol. 18, Proceedings of the International Conference on Computational Science, ICCS 2013, 2013, pp. 2213-2222.

2012

200. А.В. Бухановский, С.В. Иванов, С.В. Ковальчук, Ю.И. Нечаев Онтология интеграции знаний на основе технологии iPSE в интеллектуальной среде "облачной" модели // Онтология проектирования. 2012. № 4(6). С. 18-27.
201. В.Н. Васильев, К.В. Князьков, Т.Н. Чуров, Д.А. Насонов, С.В. Марьин, С.В. Ковальчук, А.В. Бухановский CLAVIRE: облачная платформа для обработки данных больших объемов // Информационно-измерительные и управляющие системы. 2012. Т. 10. №11. С. 7-16.
202. П.А. Смирнов, С.В. Ковальчук, А.В. Бухановский Системологический подход к проектированию и разработке предметно-ориентированных информационно-управляющих систем // Информационно-измерительные и управляющие системы. 2012. Т. 10. №11. С. 17-24.
203. К.В. Князьков, С.В. Ковальчук, А.В. Бухановский Интерактивные композитные приложения: технология для разработки информационно-измерительных и управляющих систем в распределенных средах // Информационно-измерительные и управляющие системы. 2012. Т. 10. №11. С. 40-46.
204. А.А. Безгодов, К.В. Князьков, С.В. Ковальчук, А.В. Бухановский Технология разработки нейрокомпьютерных систем виртуальной реальности на основе облачных вычислений // Нейрокомпьютеры: разработка, применение. 2012. № 11. С. 23-29.
205. К.В. Князьков, С.В. Ковальчук Особенности разработки интерактивных композитных приложений // Высокопроизводительные параллельные вычисления на кластерных системах. Материалы XII Всероссийской конференции (Н. Новгород, 26–28 ноября 2012 г.). 2012. С. 472-476.
206. П.А. Смирнов, С.В. Ковальчук Технология высокоуровневой разработки композитных приложений в рамках концепции виртуальных моделирующих объектов // Высокопроизводительные параллельные вычисления на кластерных системах. Материалы XII Всероссийской конференции (Н. Новгород, 26–28 ноября 2012 г.). 2012. С. 481-485.
207. Организация человеко-компьютерного взаимодействия в средах компьютерного моделирования на базе облачной инфраструктуры / С.В. Ковальчук, К.В. Князьков, Т.Н. Чуров, П.А. Смирнов, А.В. Бухановский // Прикладная информатика. – № 5 (41). – 2012. – С. 89-102.
208. CLAVIRE: e-Science Infrastructure for Data-driven Computing / K.V. Knyazkov, S.V. Kovalchuk, T.N. Tchurov, S.V. Maryin, A.V. Boukhanovsky // Journal of Computational Science. – Vol. 3, Issue 6. – 2012. – pp. 504–510.
209. Virtual Simulation Objects Concept as a Framework for System-Level Simulation / S.V. Kovalchuk, P.A. Smirnov, S.S. Kosukhin, A.V. Boukhanovsky // 2012 IEEE 8th International Conference on E-Science (e-Science). – 2012. – pp. 1–8.
210. High-Level Knowledge-Based Structures for Simulation within Urgent Computing Tasks / S.V. Kovalchuk, A.V. Boukhanovsky // Procedia Computer Science, Vol. 9, Proceedings of the International Conference on Computational Science, ICCS 2012. – 2012. – pp. 1694-1703.

2011

211. Knowledge-Based Resource Management for Distributed Problem Solving / S. Kovalchuk, A. Larchenko, A. Boukhanovsky // Advances in Intelligent and Soft Computing. Knowledge Engineering and Management Proceedings of the Sixth International Conference on Intelligent Systems and Knowledge Engineering, Shanghai, China, Dec 2011 (ISKE2011). – 2012 – pp. 121-128.
212. Особенности планирования процесса выполнения композитных приложений на виртуальных вычислительных ресурсах / А.А. Пащенко, С.В. Марьин, С.В. Ковальчук // Высокопроизводительные параллельные вычисления на кластерных системах. Материалы XI Всероссийской конференции (Н. Новгород, 2–3 ноября 2011 г.). – Нижний Новгород: Изд-во Нижегородского госуниверситета, 2011. – С. 234-237.
213. Марьин С.В., Ковальчук С.В. Сервисно-ориентированная платформа исполнения композитных приложений в распределенной среде // Известия высших учебных заведений. Приборостроение. – 2011. – №10. – С. 21-28.
214. Ковальчук С.В., Маслов В.Г. Интеллектуальная поддержка процесса конструирования композитных приложений в распределенных проблемно-ориентированных средах // Известия высших учебных заведений. Приборостроение. – 2011. – №10. – С. 29-35.
215. Планирование процесса выполнения композитных приложений в распределенных средах облачных вычислений / А.А  Пащенко, С.В. Марьин, С.В. Ковальчук // Интернет: инновационные технологии и инженерные разработки. Всероссийская конференция молодых ученых. Тезисы докладов. Санкт-Петербург, 13-14 октября, 18 ноября 2011 г. — СПб., 2011. - С. 20-21.
216. Автоматизация построения проблемно-ориентированных интерфейсов для прикладных сервисов в распределенных вычислительных средах / К.В. Князьков, С.В. Ковальчук, А.В. Ларченко // Интернет: инновационные технологии и инженерные разработки. Всероссийская конференция молодых ученых. Тезисы докладов. Санкт-Петербург, 13-14 октября, 18 ноября 2011 г. — СПб., 2011. - С. 17-18.

2010

217. Интеллектуальная платформа управления композитными приложениями в распределенных вычислительных средах / С.В. Марьин, С.В. Ковальчук, А.В. Ларченко // Высокопроизводительные параллельные вычисления на кластерных системах (HPC-2010): Материалы X Международной конференции: г. Пермь, 1-3 ноября 2010 г. / Пермский государственный технический университет. - Пермь, 2010. - С. 111-119.
218. Интеллектуальные технологии распределенных вычислений для моделирования сложных систем / С.В. Марьин, А.В. Ларченко, С.В. Ковальчук, К.В. Князьков, Е.В. Болгова, А.В. Бухановский // Научно-технический вестник СПбГУ ИТМО. Выпуск 70. – СПб.: СПбГУ ИТМО, 2010. – С. 123-124.
219. HPC-NASIS: Distributed Problem Solving Environment for Quantum Chemistry Computation / S.V. Maryin, S.V. Kovalchuk, A.V. Boukhanovsky, V.N. Vasiliev // Distributed Computing andGrid-Technologies in Science: Book of Abstr. Of the 4th Intern. Conf. (Dubna, June 28 – July 3, 2010). – Dubna: JINR, 2010. – p. 97-98.
     HPC-NASIS: распределенная проблемно-ориентированная оболочка для вычислений в области квантовой химии / С.В. Марьин, С.В. Ковальчук, А.В. Бухановский, В.Н. Васильев // Распределенные вычисления и грид-технологии в науке и образовании: Тез. докл. 4-й междунар. конф. (Дубна, 28 июня – 3 июля, 2010 г.). – Дубна: ОИЯИ, 2010. – С. 98-99.
220. Марьин С.В., Ковальчук С.В. Сервисно-ориентированная распределенная среда управления прикладными вычислительными пакетами // Сборник статей участников Всероссийского конкурса научных работ студентов и аспирантов «Телематика'2010: телекоммуникации, веб-технологии, суперкомпьютинг». – СПб: СПбГУ ИТМО, 2010. - С. 205-206.
221. Ковальчук С.В., Бухановский А.В. Онтологический подход к построению интеллектуального управляющего ядра суперкомпьютерных приложений нового поколения // Сборник статей участников Всероссийского конкурса научных работ студентов и аспирантов «Телематика'2010: телекоммуникации, веб-технологии, суперкомпьютинг». – СПб: СПбГУ ИТМО, 2010. - С. 208-210.
222. Гуськов А.А. Профессиональная коллаборативная интернет-среда в области компьютерного моделирования в нанотехнологиях / А.А. Гуськов, А.В. Ларченко, С.В. Ковальчук // Cборник статей участников Всероссийского конкурса научных работ студентов и аспирантов «Телематика'2010: телекоммуникации, веб-технологии, суперкомпьютинг», – СПб: СПбГУ ИТМО, 2010. C. 210 – 211.
223. Динамическое управление распределенными вычислительными ресурсами в составе композитного приложения / С.В. Марьин, С.В. Ковальчук [и др.] // Научно-технический вестник СПбГУ ИТМО. Выпуск 67. – СПб.: СПбГУ ИТМО, 2010. – С. 126-126.
224. Марьин С.В. Сервисно-ориентированная распределенная среда управления прикладными вычислительными пакетами / С.В. Марьин, С.В. Ковальчук // Технологии Microsoft в теории и практике программирования. Материалы конференции (Нижний Новгород, 13-14 мая 2010 г.). – Нижний Новгород: Изд-во Нижегородского госуниверситета, 2010. – С. 427-429.

2009

225. Интеллектуальные высокопроизводительные программные комплексы моделирования сложных систем: концепция, архитектура и примеры реализации / А.В. Бухановский, С.В. Ковальчук, С.В. Марьин // Известия высших учебных заведений. Приборостроение. – 2009. – №10. – С. 5-24.
226. Подходы к конструированию интеллектуальных высокопроизводительных композитных приложений для моделирования сложных систем / С.В. Ковальчук [и др.] // Высокопроизводительные параллельные вычисления на кластерных системах. Материалы Девятой международной конференции-семинара. Владимир, 2-3 ноября 2009 г. – Владимир: Издательство ВлГУ, 2009. – С. 219-224.
227. Особенности построения масштабируемых композитных вычислительных приложений для моделирования сложных систем / С.В. Ковальчук [и др.] // Научный сервис в сети Интернет: масштабируемость, параллельность, эффективность: Труды Всероссийской суперкомпьютерной конференции (21-26 сентября 2009 г.,г. Новороссийск). – М.: Изд-во МГУ, 2009. – С. 53-57.

2008

228. Особенности проектирования высокопроизводительных программных комплексов для моделирования сложных систем / С.В. Ковальчук [и др.] // Информационно-управляющие системы. – 2008. – №3. – С. 10-18.
229. Ковальчук С.В. Параллельная производительность стохастических алгоритмов / С.В. Ковальчук, А.В. Бухановский // Известия высших учебных заведений. Приборостроение. – 2008. – №12. – С. 7-14.
230. Высокопроизводительный программный комплекс моделирования экстремальных гидрометеорологических явлений. Часть I: Постановка задачи, модели, методы и параллельные алгоритмы / А.В. Бухановский, С.В. Ковальчук [и др.] // Научно-технический вестник СПбГУ ИТМО. Выпуск 54. Технологии высокопроизводительных вычислений и компьютерного моделирования. – СПб.: СПбГУ ИТМО, 2008. – С. 56-63.
231. Высокопроизводительный программный комплекс моделирования экстремальных гидрометеорологических явлений. Часть II: Разработка и оценка программной архитектуры / С.В. Ковальчук [и др.] // Научно-технический вестник СПбГУ ИТМО. Выпуск 54. Технологии высокопроизводительных вычислений и компьютерного моделирования. – СПб.: СПбГУ ИТМО, 2008. – С. 64-71.
232. Высокопроизводительный программный комплекс моделирования экстремальных гидрометеорологических явлений. Часть III: Интерпретация и использование результатов расчетов / С.В. Иванов, С.В. Ковальчук [и др.] // Научно-технический вестник СПбГУ ИТМО. Выпуск 54. Технологии высокопроизводительных вычислений и компьютерного моделирования. – СПб.: СПбГУ ИТМО, 2008. – С. 72-79.
233. Ковальчук С.В. Особенности адаптации параллельных алгоритмов к архитектуре графических акселераторов / С.В. Ковальчук, С.М. Вишняков // Научно-технический вестник СПбГУ ИТМО. Выпуск 54. Технологии высокопроизводительных вычислений и компьютерного моделирования. – СПб.: СПбГУ ИТМО, 2008. – С. 92-99.
234. Моделирование экстремальных явлений в атмосфере и океане как задача высокопроизводительных вычислений / А.В. Бухановский, С.В. Ковальчук [и др.] // Вычислительные методы и программирование. – 2008. – Том 9. – С. 141-153.
235. Особенности адаптации вычислительных алгоритмов под параллельную вычислительную архитектуру GPU и Cell / С.М. Вишняков, С.В. Ковальчук [и др.] // 8-я Международная конференция. Высокопроизводительные параллельные вычисления на кластерных системах (17–19 ноября 2008 г., г. Казань). Труды конференции. – Казань: Издательство КГТУ, 2008. – С. 48-52.
236. Высокопроизводительный программный комплекс моделирования экстремальных гидрометеорологических явлений: эффективное управление параллельными вычислениями и представление результатов расчетов / С.В. Ковальчук [и др.] // Научный сервис в сети Интернет: решение больших задач: Труды Всероссийской научной конференции (22-27 сентября 2008 г., г. Новороссийск). – М.: Изд-во МГУ, 2008. – С. 106-108.
237. Бухановский А.В. Стохастический анализ параллельной производительности программных систем / А.В. Бухановский, С.В. Ковальчук // Научный сервис в сети Интернет: решение больших задач: Труды Всероссийской научной конференции (22-27 сентября 2008 г., г. Новороссийск). – М.: Изд-во МГУ, 2008. – С. 132-135.
238. Ковальчук С.В. Адаптация сервисно-ориентированного подхода для проектирования архитектуры высокопроизводительных программных комплексов моделирования сложных систем / С.В. Ковальчук, А.В. Бухановский // Труды XV Всероссийской научно-методической конференции Телематика’2008. Том 1.– СПб.: СПбГУ ИТМО, 2008. – С. 106-107.
239. Ковальчук С.В. Проектирование и разработка высокопроизводительного программного комплекса моделирования экстремальных явлений в атмосфере и океане на основе распределенных технологий .NET / С.В. Ковальчук, С.В. Иванов, А.В. Бухановский // Технологии Microsoft в теории и практике программирования. Материалы конференции (Нижний Новгород, 19-20 марта 2008 г.). – Нижний Новгород: Изд-во Нижегородского госуниверситета, 2008. – С. 171-173.
240. Моделирование экстремальных явлений в атмосфере и океане как задача высокопроизводительных вычислений / А.В. Бухановский, С.В. Ковальчук [и др.] // Параллельные вычислительные технологии (ПаВТ'2008): Труды международной научной конференции (Санкт-Петербург, 28 января – 1 февраля 2008 г.). – Челябинск: Изд-во ЮУрГУ, 2008. – С. 57-68.
241. Вишняков С.М. Особенности адаптации вычислительных алгоритмов под параллельную архитектуру графических акселераторов / С.М. Вишняков, С.В. Ковальчук, А.В. Бухановский // Параллельные вычислительные технологии (ПаВТ'2008): Труды международной научной конференции (Санкт-Петербург, 28 января – 1 февраля 2008 г.). – Челябинск: Изд-во ЮУрГУ, 2008. – С. 340-346.
242. Ковальчук С.В. Параллельная производительность стохастических алгоритмов / С.В. Ковальчук, И.А. Пименов, А.В. Бухановский // Параллельные вычислительные технологии (ПаВТ'2008): Труды международной научной конференции (Санкт-Петербург, 28 января – 1 февраля 2008 г.). – Челябинск: Изд-во ЮУрГУ, 2008. – С. 403-410.

2007

243. Проблемы переноса вычислительных приложений кластерного уровня в среду Грид на примере Grid Programming Environment / А.В. Ларченко, С.В. Ковальчук [и др.] // Научный сервис в сети Интернет: многоядерный компьютерный мир. 15 лет РФФИ: Труды Всероссийской научной конференции (24-29 сентября 2007 г., г. Новороссийск). – М.: Изд-во МГУ, 2007. – С. 134.
244. Ковальчук С.В. Сравнительный анализ технологий параметризации нелинейной функции случайных аргументов в задаче статистического описания спектрального волнового климата // Сборник тезисов IV межвузовской конференции молодых ученых. – СПб: СПбГУ ИТМО, 2007. – С. 82-83.

Before 2007

245. Ковальчук С.В. Разработка одноранговой распределенной вычислительной системы / С.В. Ковальчук, А.Ю. Владова // Высокопроизводительные параллельные вычисления на кластерных системах. Материалы пятого Международного научно-практического семинара. – Нижний Новгород: Изд-во Нижегородского госуниверситета, 2005. – С. 124–130.
246. Генералов О.Е., Ковальчук С.В. Твердотельное моделирование сложных объектов с помощью CAD/CAM технологий // XXIV Научная конференция студентов ОГУ. Сборник тезисов докладов. – Оренбург, 2002. – C. 28-31.